SUMO化位点鉴定

*此项目适合蛋白SUMO化修饰初步定性分析,常规样本为SDS-PAGE和蛋白溶液样本。

SUMO化是一种可逆的蛋白翻译后修饰,经常发生在蛋白的赖氨酸残基,伴随链接着11KDa的泛素类似的调节短肽。最重要的是SUMO化还参与一系列蛋白功能,包括转录因子调控,蛋白相互作用以及蛋白亚细胞定位等。

与泛素化类似的,SUMO化修饰过程需要3种酶的参与协助完成,SUMO-E1(activating enzyme),SUMO-E2(conjugating enzyme),SUMO-E3(Ubi-protein ligase)。随着生物信息学与质谱技术的迅猛发展,精准高通量的方法已经广泛应用于发掘SUMO化修饰底物和位点,这对解密蛋白SUMO化修饰参与的疾病发病机理有重要帮助。

关于细胞内SUMO化修饰的研究发现,SUMO化修饰通过各种方法影响着蛋白的功能,尽管其对蛋白-蛋白相互作用的调控已经被大家认可,但是近期研究发现SUMO化修饰的发生也可能影响着染色质蛋白与DNA,下图中是关于SUMO化修饰DNA结合蛋白后,不同的功能调控。

  • SUMO化可以使蛋白单体聚合或者分离;
  • SUMO可以使蛋白间互作发生切换;
  • SUMO化可促使DNA与蛋白质之间相互结合

SUMO化修饰除了会参与蛋白-蛋白,蛋白-DNA相互作用的调控之外,最重要的是更多研究发现蛋白发生SUMO化修饰可能会与人类疾病的发生发展有关,例如,心血管疾病,癌症,神经退行性疾病和免疫疾病。

在我们前面提及的,SUMO化修饰研究手法主要是通过生物信息学与液质联用的结合,可以依赖生信分析预测可能发生的修饰位点。

AIMS提供的是高效专业的蛋白乙酰化鉴定服务,有专业的HPLC-MS/MS质谱平台,可以分析各种真核生物和原核生物样本。

服务内容

  • 凝胶或溶液内蛋白酶解(depends on type of samples you send us)
  • SUMO化肽段富集(optional; depends on the abundance of phosphor-peptide)
  • HPLC分级, 随后进行串联质谱MS/MS 分析
  • 质谱数据分析SUMO化位点发掘

服务优势

高精度与准确性:采用Thermo Fisher 质谱仪,可以发现具体修饰肽段和修饰位点。

位点覆盖率高(可选):可对SUMO化肽段进行富集,提高检测效果。

简单快捷方便:样本准备简单,实验周期短,结果可靠。

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泛素化位点修饰