蛋白胶内质谱

蛋白样本通过1D或者2D凝胶电泳分离后,可以通过考马斯亮蓝染色或者银染染色使蛋白能够可视化,并且选取感兴趣的蛋白进行后续质谱LC-MS/MS进行分析。

胶内蛋白质谱的最大优点就是电泳过程中避免污染物(例如,去污剂或者无机盐)影响后续实验,并且进行酶切后的多肽能够很容易的进行分析检测。然而,胶内质谱的方法有一些局限性,酶切过程中切碎的肽段不容易从凝胶中有效释放到溶液中。另外也可以选择结合溶液内质谱(超链接到溶液内质谱)的方法,通常会在质谱上机前进行1D或2D分离多肽。

服务流程图

服务内容

  • 胶内酶切,一般默认胰酶,可选择其他酶。
  • 质谱检测上机,原始数据调取后搜库分析。
  • 数据谱图的抽取,可做简单生物信息分析。

服务优势

高精度与准确性:采用Thermo Fisher 高精度高分辨质谱仪,可对蛋白序列进行精度检测,上机时长120min更高的肽段覆盖率。

简单快速便捷:样本准备简单,检测周期短,约一周出报告。

双重保险:若检测结果明显是质谱问题,可免费重启上机一次。

不同凝胶质谱比较

优势 不足
1D 成本低; 易准备; 经典分离方法 胶中蛋白残留和损失影响鉴定数据的完整和全面
2D 分离上千个完整蛋白 耗时费力,重复性差
DIGE 增加2D凝胶电泳的分析速度和准确性 耗时费力,重复性差,成本高

FAQ+(可展开)

样本准备

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